Si de temas controvertidos hablamos, a nivel nacional el Partido Morena se encuentra inmiscuido de encubrimiento de dos afiliados acusados de degollar a un menor de edad y que fueron puestos en libertad al cobijo de este partido.
Al respecto Manuel Zavala se limitó a decir, que será Andrés Manuel López Obrador quien juzgue a estos presuntos culpables.